In de agrovoedselindustrie gelden strenge schoonmaakprotocollen voor clean rooms. Volgens de bron moeten deze ruimten worden gereinigd volgens een vaste volgorde van boven naar beneden en van binnen naar buiten, met gebruik van vezelvrije materialen en goedgekeurde desinfectiemiddelen. De maatstaven sluiten aan bij ISO 14644 en HACCP, waarbij HEPA-filtratie, positieve luchtdruk en gespecialiseerd personeelsgoed essentieel zijn om kruisbesmetting te voorkomen. Ook voor Nederlandse facility-afdelingen in de food- en farmasector zijn deze hygiënische kaders direct toepasbaar bij het optimaliseren van schoonmaakprocessen en gebouwontwerp.